UltiMaker a été fondée en 2011 par Erik de Bruijn, Martijn Elserman et Siert Wijnia, tous issus de la communauté RepRap (projet d'impression 3D ouverte). Leur première imprimante, UltiMaker Original (2011), était un kit DIY à €1000. Elle était open source: tous les fichiers CAO, schémas et logiciels étaient publiés librement.
UltiMaker 2 (2013) fut révolutionnaire, €1500 pour une imprimante FDM plug-and-play avec une précision de 200 µm, sans précédent à l'époque. Elle est devenue la référence en Europe pour l'enseignement de l'ingénierie et le prototypage.
UltiMaker 3 (2016), ajout d'un second extrudeur pour les structures de support dans un matériau différent (PVA, soluble dans l'eau).
UltiMaker S5 (2018), version suivante avec webcam, logiciel de gestion cloud intégré, fonctionnement multi-réseau. €5500.
En 2022, UltiMaker a fusionné avec MakerBot (concurrent américain axé sur l'éducation), formant NewCo, renommée UltiMaker. Cela a donné à l'entreprise accès au marché américain et au portefeuille MakerBot (Sketch, Method).
UltiMaker S7 (2023), modèle phare actuel. €5800 de base, €7200 avec le système de filtration Air Manager. Design fermé, compatible avec plus de 200 filaments.