UltiMaker è stata fondata nel 2011 da Erik de Bruijn, Martijn Elserman e Siert Wijnia, tutti con background nella comunità RepRap (progetto di stampa 3D aperta). La loro prima stampante, UltiMaker Original (2011), era un kit DIY da €1000. Era open source: tutti i file CAD, gli schemi e il software erano liberamente pubblicati.
UltiMaker 2 (2013) è stata rivoluzionaria, €1500 per una stampante FDM plug-and-play con precisione di 200 µm, senza precedenti all'epoca. È diventata lo standard aziendale in Europa per la didattica ingegneristica e la prototipazione.
UltiMaker 3 (2016), ha aggiunto un secondo estrusore per le strutture di supporto in un materiale diverso (PVA, solubile in acqua).
UltiMaker S5 (2018), versione successiva con webcam, software di gestione integrato basato su cloud, gestione multi-rete. €5500.
Nel 2022 UltiMaker si è fusa con MakerBot (concorrente statunitense focalizzato sull'istruzione), formando NewCo, che si è ribattezzata UltiMaker. Questo ha dato all'azienda accesso al mercato statunitense e al portfolio MakerBot (Sketch, Method).
UltiMaker S7 (2023), top di gamma attuale. Base €5800, €7200 con il sistema di filtraggio Air Manager. Design chiuso, compatibile con materiali agnostici tra oltre 200 filamenti supportati.