Stratasys, Scott Crump'ın FDM teknolojisini patentlemesinin ardından 1989'da faaliyete başladı. İlk yazıcı, 3D Modeler, 1992'de piyasaya çıktı.
1995, Şirket NASDAQ'a kote oldu.
2001, İlk masaüstü Stratasys FDM yazıcısı olan Dimension serisi tanıtıldı.
2012, Stratasys, çok renkli PolyJet baskı için İsrailli şirket Objet ile birleşti. Bu adım Stratasys'e eksiksiz bir portföy kazandırdı: FDM + PolyJet.
2013, MakerBot (masaüstü FDM) satın alındı. Bu hamle ticari bir başarısızlıkla sonuçlandı; MakerBot masaüstü segmentinde Bambu Lab ve Prusa ile rekabet edemedi. 2022'de MakerBot, UltiMaker ile birleşti.
2018-3D Hubs (çevrimiçi 3D baskı hizmeti) satın alındı.
2019, Origin (CLIP benzeri SLA teknolojisi) satın alındı.
2021, Xaar 3D satın alınarak Selective Absorption Fusion alanına girildi.
2023, Endüstriyel üretim için yeni modüler P3 yazıcı Stratasys V650 Flex piyasaya sürüldü.
2026 itibarıyla Stratasys, kurulu baz açısından dünyanın en büyük 3D baskı şirketi olmayı sürdürmekte olup dünya genelinde 30.000'den fazla endüstriyel yazıcısı bulunmaktadır.